Ciekawą ofertą dla aktywnych studentów są koła naukowe, w ramach których odbywają się cykliczne spotkania oraz międzyuczelniane konferencje. Inicjatywa kół naukowych pozwala rozszerzyć oraz zgłębić zagadnienia wykraczające poza standardowy kurs studiów. Dla chętnych studentów jest to doskonała okazja do rozszerzenia własnej wiedzy oraz zgłębienia interesujących ich zagadnień.
Obecnie studenci Wydziału Matematyczno-Fizycznego, już od wielu lat, angażują się w działalność w ramach niżej wymienionych kół naukowych: